{"id":49099,"date":"2024-02-04T22:59:50","date_gmt":"2024-02-05T03:59:50","guid":{"rendered":"https:\/\/einsteresante.com\/?p=49099"},"modified":"2024-02-04T22:59:51","modified_gmt":"2024-02-05T03:59:51","slug":"los-genomas-de-51-especies-de-animales-son-mapeados-en-tiempo-record-creando-una-maquina-del-tiempo-evolutiva","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/einsteresante.com\/index.php\/2024\/02\/04\/los-genomas-de-51-especies-de-animales-son-mapeados-en-tiempo-record-creando-una-maquina-del-tiempo-evolutiva\/","title":{"rendered":"Los genomas de 51 especies de animales son mapeados en tiempo r\u00e9cord creando una “m\u00e1quina del tiempo evolutiva”"},"content":{"rendered":"\n

Los investigadores acaban de mapear y publicar los genomas de 51 especies animales, desde cocodrilos que se alimentan de peces conocidos como gaviales (Gavialis gangeticus<\/em>) hasta feroces panteras nebulosas (Neofelis nebulosa<\/em>). Estos planos gen\u00e9ticos podr\u00edan tener amplias implicaciones para los humanos, particularmente para comprender nuestra historia evolutiva, seg\u00fan un art\u00edculo publicado el 26 de enero en la revista Nature Biotechnology<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

“En cierto modo, estamos construyendo una m\u00e1quina del tiempo evolutiva”, dijo en un comunicado el coautor del estudio Michael Schatz, profesor distinguido de ciencias inform\u00e1ticas y biolog\u00eda de Bloomberg en la Universidad Johns Hopkins. “Tener un mapa de los genes de nuestros primos evolutivos nos ayudar\u00e1 a comprendernos mejor a nosotros mismos”.<\/p>\n\n\n\n

Todos los mam\u00edferos comparten un ancestro com\u00fan, que muchos cient\u00edficos creen que es Morganucodon<\/em>, una criatura diminuta parecida a una musara\u00f1a que vivi\u00f3 hace m\u00e1s de 200 millones de a\u00f1os, aunque algunos dicen lo contrario. En cualquier caso, este ancestro compartido significa que una gran parte de nuestra composici\u00f3n gen\u00e9tica se parece a la de otros mam\u00edferos, particularmente los chimpanc\u00e9s, que comparten hasta el 99% de nuestro ADN. Al comparar el ADN de humanos y otros animales, los investigadores pueden aprender cu\u00e1ndo y c\u00f3mo los humanos se separaron de otras especies.<\/p>\n\n\n\n

Pero un solo genoma de vertebrado puede tener miles de millones de caracteres y los investigadores deben usar diferentes herramientas para dividir este material gen\u00e9tico en pedazos antes de reconstruirlo en una imagen completa. Como resultado, el mapeo de los genomas ha sido hist\u00f3ricamente un proceso minucioso: a partir de 1990, los investigadores tardaron 13 a\u00f1os en crear el primer modelo gen\u00e9tico para humanos.<\/p>\n\n\n\n

Sin embargo, la tecnolog\u00eda de mapeo de ADN para diferentes especies ha avanzado r\u00e1pidamente en las \u00faltimas d\u00e9cadas, y este nuevo proyecto marca un paso m\u00e1s, reduciendo el tiempo de secuenciaci\u00f3n de a\u00f1os y meses a solo d\u00edas. Para ello, el equipo utiliz\u00f3 investigaciones de dos proyectos: el Proyecto Genomas de Vertebrados y el Atlas Europeo del Genoma de Referencia. A partir de estos, desarrollaron algoritmos y software para ensamblar segmentos gen\u00e9ticos cortos en un mapa gen\u00e9tico completo y, finalmente, probaron qu\u00e9 tan bien su flujo de trabajo reproduc\u00eda el genoma completo de un pinz\u00f3n cebra (Taeniopygia guttata<\/em>), que se hab\u00eda publicado previamente.<\/p>\n\n\n\n

El equipo descubri\u00f3 que su nueva tecnolog\u00eda era m\u00e1s eficaz que los enfoques existentes para volver a ensamblar segmentos del genoma y crear un mapa preciso. Su software es de c\u00f3digo abierto y est\u00e1 disponible en l\u00ednea a trav\u00e9s de Galaxy, una plataforma web gratuita con sede en Johns Hopkins y la Universidad Estatal de Pensilvania.<\/p>\n\n\n\n

“Creo que lo primero que pens\u00e9 fue, vaya, realmente hicieron que esto funcionara”, dijo a Live Science Elinor Karlsson, directora del Grupo de Gen\u00f3mica de Vertebrados del Instituto Broad y profesora de la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts, que no particip\u00f3 en el estudio. “Es realmente genial ver no s\u00f3lo que lograron crear un sistema que parece funcionar bien en especies muy diversas, sino que lo hicieron en una plataforma que est\u00e1 tan comprometida con la ciencia abierta y el intercambio de flujos de trabajo”.<\/p>\n\n\n\n

Para este art\u00edculo, los investigadores se centraron \u00fanicamente en los vertebrados, y otras especies de animales, plantas u hongos podr\u00edan tener “algo distintivo o \u00fanico en su genoma”, lo que significa que “algunos de los procesos que est\u00e1n en este proceso no van a funcionar como bien en esa especie”, afirm\u00f3 Karlsson.<\/p>\n\n\n\n

Pero esto podr\u00eda solucionarse “modificando algunos par\u00e1metros” en su t\u00e9cnica, seg\u00fan el art\u00edculo. El objetivo de los investigadores es secuenciar los genomas de al menos una especie en los 275 \u00f3rdenes de vertebrados.<\/p>\n\n\n\n

Fuente: Live Science<\/a>.
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