El juego, GENIGMA, sale hoy en iOS y Android y está disponible en inglés, español, catalán e italiano. Es el resultado de una colaboración de dos años y medio entre investigadores del Centro de Regulación Genómica (CRG), el Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) y profesionales locales de los videojuegos.
En la superficie, GENIGMA es un juego de resolución de acertijos en el que los jugadores organizan bloques de diferentes colores y formas en varias configuraciones para lograr la puntuación más alta posible. En el fondo, sin embargo, la forma en que los jugadores resuelven estos acertijos ayuda a los investigadores a desenredar las secuencias genéticas para crear “líneas de células cancerosas”, información que puede ayudar a combatir el cáncer de mama.
Juega por la causa
“Las líneas celulares son las responsables del descubrimiento de vacunas, quimioterapias para el cáncer o FIV para la infertilidad. Esto los convierte en un pilar de la biología moderna”, explica el profesor de investigación ICREA Marc A. Marti-Renom, con doble afiliación en el CRG y el CNAG-CRG y cuya investigación sustenta GENIGMA.
“Sin embargo, la falta de mapas de referencia del genoma limita el progreso científico actual. Es como pedirle a la gente que navegue por las ciudades modernas usando mapas del pasado. Con la ayuda de otras personas, podemos actualizar estos mapas, lo que nos permitirá avanzar rápidamente en la investigación del cáncer de mama”.
GENIGMA fue diseñado para ayudar a impulsar los esfuerzos de investigación del mundo en líneas de cáncer, ya que esta información es fundamental para estudiar las células cancerosas y cómo interactuarían con varios medicamentos. Uno de los mayores problemas que tienen los investigadores que estudian estas líneas celulares es la falta de mapas de referencia del genoma precisos y de alta resolución, que les permitan identificar la ubicación exacta de ciertos genes.
El equipo detrás del juego cree que los datos generados por jugadores humanos serían un enfoque más efectivo para generar o actualizar estos mapas en comparación con el uso de IA solo para la tarea. Si bien la IA es confiable, dicen que la “inteligencia de rebaño” de los jugadores puede ayudar a proporcionar algunas soluciones creativas que los sistemas automatizados tal vez no puedan alcanzar. Durante el desarrollo de GENIGMA, los investigadores desarrollaron una serie de métodos para crear mapas de referencia genómicos mediante la visualización del genoma en un espacio tridimensional.
Cada cuerda con la que los jugadores juegan en el juego representa una secuencia genética en la línea de células cancerosas. La forma en que los jugadores organizan los bloques en cada cadena es una estructura potencial de estas secuencias, lo que indica la posible ubicación de los genes individuales. Cuantos más jugadores participan, aumenta el volumen y la calidad de los datos que los investigadores extraen del juego.
“Cualquier persona con un teléfono inteligente desde cualquier parte del mundo puede descargar GENIGMA de forma gratuita y hacer una contribución directa a la investigación, poniendo su lógica y destreza al servicio de la ciencia”, dice Elisabetta Broglio, facilitadora de ciencia ciudadana del CRG. “GENIGMA analizará las soluciones proporcionadas por los jugadores como colectivo y no como individuos, y aprovechará soluciones creativas imposibles de encontrar con algoritmos deterministas”.
El juego se lanzó hoy y los investigadores están planeando una campaña de tres meses (el #GenigmaChallenge) para marcar el evento. Todos los lunes durante los próximos tres meses, presentarán nuevos fragmentos del genoma de una determinada línea celular (T-47D) para que los jugadores los organicen. Esta línea celular está implicada en la aparición del cáncer de mama y es uno de los recursos más utilizados en la investigación del cáncer. El primer fragmento que los jugadores tendrán disponible para organizar es el del cromosoma 17, donde reside una gran cantidad de genes asociados con el cáncer de mama. Estos incluyen BRCA1, cuyas mutaciones están asociadas con alrededor del 40% de los casos de cáncer de mama heredado.
El juego fue producido por más de 500 personas en 13 talleres diferentes. Personas de diversos campos colaboraron durante su desarrollo, desde artistas y desarrolladores de juegos hasta investigadores, estudiantes, especialistas en bioética y representantes de organizaciones de pacientes.
“La ciencia a menudo puede parecer inaccesible para la mayoría de las personas, por lo que es tan emocionante poder levantar el teléfono para jugar GENIGMA. No solo puedes combinar el atractivo universal y la popularidad de los videojuegos para contribuir al avance de la investigación médica, sino que también aprenderás más sobre la ciencia”, dice Oriol Ripoll, creativo de Jocs al Segon y coordinador del equipo de diseño de juegos de GENIGMA.
Según las estimaciones del equipo, si 30.000 jugadores resuelven una media de 50 juegos cada uno, producirían datos suficientes para crear el mapa de referencia de los 20.000 genes de esta línea celular. ¡Así que ponte a jugar!
Fuente: ZME Science.
